1969 年 6 月 7 日，拜仁击败汉诺威，夺得了他们的第一个德甲联赛冠军奖杯。让我们回顾一下拜仁 26 次联赛冠军中的第一个。
1963 年德甲联赛成立时，拜仁还不是顶级联赛的成员。当时的联赛只希望有一支慕尼黑球队能够进入顶级联赛，那就是 1962/63 赛季的州级联赛球队——慕尼黑 1860 队。
拜仁在那个赛季仅次于纽伦堡获得第三名，而他们身后的法兰克福、卡尔斯鲁厄和斯图加特也受邀参加德甲联赛的首个赛季。
然而，当时的俱乐部主席威廉·诺伊德克尔 ( ) 称之为“可耻的不公正”的行为，却可能是因祸得福：“金融危机……迫使俱乐部放弃身价不菲的球星，提拔青年队的球员，其中包括来自巴伐利亚省的天才球员。”
诺伊德克应对危机的方式是进一步使俱乐部职业化，并任命在科隆取得巨大成功的南斯拉夫·柴科夫斯基担任主教练。
拜仁必须保持耐心，但年轻的门将塞普·迈耶（Sepp Meier）——他很快就被昵称为“安辛的猫”——逐渐成长为一线队球员。贝肯鲍尔在 4-0 战胜圣保利的比赛中首次亮相并进球。那是 1964 年 6 月，球队终于进入了升级附加赛。
另一个决定性因素是那一年的合同，拜仁击败 1860 签下了盖德·穆勒。当时年仅 19 岁的前锋于 10 月首次代表该俱乐部出场，并于次年攻入 33 球。
足球皇帝贝肯鲍尔后来回忆说，这场附加赛对拜仁成为欧洲顶级俱乐部之一起到了很大的作用。
“我们这支球队有迈尔、穆勒、布伦宁格、纳夫齐格拜仁德甲冠军，像这样的机会只有一次。”贝肯鲍尔盛赞柴可夫斯基的进攻理念，“没有人能像他那样挖掘潜力，他创造了这支球队。”
1965年8月，拜仁在首场德甲比赛中以0-1输给了同城对手慕尼黑1860队。
不过积分榜开始出现逆转，1966年1月，拜仁在第二次交手中以3-0击败对手，最终夺得该赛季的季军，落后1860 3分，净胜球数仅落后于多特蒙德。
随后，拜仁在德国杯决赛中以4-2战胜多特蒙德，并于1967年卫冕冠军。柴可夫斯基的球队还在同年夺得欧洲优胜者杯，在加时赛中击败格拉斯哥流浪者队。
带领拜仁首次夺得德甲联赛冠军的是另一位克罗地亚教练：柴可夫斯基的国家队队友布兰科·泽贝克，他在担任萨格勒布迪纳摩队教练期间就已经声名鹊起。
1967 年，在博览会杯（欧洲杯的前身）中，萨格勒布击败利兹联队。之后，泽贝克在 1968/69 赛季转会到慕尼黑，并带来了更为严格的训练方法和更为务实的比赛态度。
“他为球队创造了一种新风格，”贝肯鲍尔回忆道。“更加专业，更加有序，更加纪律严明。”
这支拜仁队依然以迈尔、贝肯鲍尔和穆勒为核心，开局五连胜，攻入15球拜仁德甲冠军，首场失利发生在联赛第11轮，整个赛季仅输掉6场比赛，将劲敌亚琛的一半输球数甩在身后。
联赛第27轮，拜仁1-1战平亚琛，锁定联赛冠军。那个赛季，他们只用了13名球员，其中8人打满34场比赛。虽然球队人才济济，但还是有一些球员表现突出。
至今，盖德·穆勒仍保持着德甲射手王的记录拜仁德甲冠军，他在365个联赛进球中，有30个帮助泽贝茨基夺得德甲冠军。布伦宁格和奥尔豪泽贡献了19个进球，但盖德·穆勒几乎贡献了拜仁一半的进球。“没有盖德，拜仁就没有今天的成就。”贝肯鲍尔常说。
联赛结束一周后，穆勒又梅开二度，帮助球队击败沙尔克，夺得德国杯冠军。
门兴格拉德巴赫在后来成为拜仁慕尼黑主帅的尤普·海因克斯的带领下，于次年向冠军发起挑战。20 世纪 70 年代的冠军争夺战十分激烈，但拜仁在举起他们的第一个联赛奖杯后，就再也没有回头。